1. Edificarea statutului de drept şi punerea în valoare a patrimoniului cultural şi istoric al Moldovei în contextul integrării europene

Direcţia ştiinţifică: Consolidarea societăţii din Republica Moldova în contextul integrării europene

Direcţia ştiinţifică: Bazele conceptuale şi metodologice ale modernizării sistemului de învăţămînt din Republica Moldova

Direcţia ştiinţifică: Cercetarea culturii tradiţionale, diversităţii biologice şi paleontologice cu scopul completării colecţiilor muzeale, tezaurizării conservării, valorificării ştiinţifice şi promovării patrimoniului cultural şi natural al Republicii Moldova

2. Valorificarea resurselor umane, naturale şi informaţionale pentru dezvoltarea durabilă

Direcţia ştiinţifică: Valorificarea istoriei Moldovei în contextul civilizaţiei europene, căile de consolidare şi dezvoltare a statului de drept din perspectiva integrării europene

Direcţia ştiinţifică: Literatura română si folclorul din Moldova. Limba româna sub aspect structural, funcţional si istoric Direcţia ştiinţifică: Geneza, evoluţia şi valorificarea patrimoniului etno-cultural şi artistic al Moldovei

Direcţia ştiinţifică: Diseminarea cunoştinţelor ştiinţifice din diverse domenii de cercetare, atît în plan naţional, cît şi internaţional

Direcţia ştiinţifică: Valorificarea ştiinţifică şi publică a patrimoniului muzeal

Direcţia ştiinţifică: Cercetări muzeologice